Im Dezember wurde der erste BioHackathon Deutschland vom Team des deutschen ELIXIR-Knotens organisiert. Leyla Jael Garcia-Castro (ZBMed und NFDI4Microbiota) und Steffen Neumann (IPB Halle und NFDI4Chem) nutzten die Gelegenheit und reichten erfolgreich einen Antrag zu (Bio)Schemas4NFDI ein.
Bioschemas ist ein Gemeinschaftsprojekt zur Verbesserung der FAIRness von Ressourcen in den Biowissenschaften durch die Definition spezifischer Metadatenschemata als JSON+LD und die Veröffentlichung dieser Metadaten von teilnehmenden Ressourcen. Der Name Bioschemas ist ein wenig irreführend, da die Metadatenschemata von Anfang an auch Konzepte aus der Chemie oder sogar Informationen über Lehrmaterial und Veranstaltungen umfassten.
Ziel des Hacking-Workshops war es, Metadatenexperten von Bioschemas und verschiedenen NFDI-Konsortien zusammenzubringen, um Bioschemas für NFDI-Anwendungsfälle zu übernehmen und anzupassen. Wir hatten Teilnehmer u.a. von NFDI4DataScience, GHGA, NFDI4Microbiota und sieben Teilnehmer von NFDI4Chem.
Actual Hacking war in die Abteilung Datenanbieter unterteilt, wo wir die Anzahl der unterstützenden Ressourcen und den Umfang der bereitgestellten Schema-Metadaten verbesserten. In der Abteilung Neue und verbesserte Schemata haben wir an der Verbesserung des analytischen DataSets und des neuen chemischen Reaktionstyps gearbeitet. Die Abteilung Abfragen / Sammeln / Verwertung hatte Teilnehmer*innen von IPB und TIB und arbeitete daran, all diese Metadaten für Sie nutzbar zu machen. Es ist uns gelungen, Daten von BioSchema-Anbietern (MassBank) abzurufen und sie im NFDI4Chem-Suchdienst zusammenzuführen. Die Präsentation von Denitsa Eckweiler (TU Braunschweig) zeigte, wie PubPharm derzeit Informationen sammelt, die für die pharmazeutische Chemie nützlich sind, und wir diskutierten, wie Metadaten zu chemischen Daten in Zukunft einbezogen werden könnten.
Und schließlich lesen Sie gerade die erste Ausgabe der Abteilung für Verbreitung und Öffentlichkeitsarbeit, zu der noch weitere folgen werden. Wir werden unsere Erfahrungen in die NFDI-Sektion Metadaten einbringen, und wenn alles klappt, werden Sie 2023 beim NFDI-eigenen Metadaten-Hackathon oder bei der NFDI-Konferenz im September in Karlsruhe mehr sehen.
Tweets von de.NBI inklusive einiger Bilder finden Sie hier.
