Neue Version von Cheminformatics Microservice

Cheminformatics Microservice ist eine Open-Source-Lösung, die Entwicklern und Forschern eine einheitliche REST-Schnittstelle für den Zugriff auf häufig genutzte Funktionen von Cheminformatik-Toolkits wie RDKit, Chemistry Development Kit (CDK) und Open Babel bietet, ohne dass diese installiert und gewartet werden müssen. Es bietet gebrauchsfertige Routinen für gängige Aufgaben wie (aber nicht nur) die Generierung von chemischen Strukturdarstellungen, 3D-Konformeren, Deskriptoren, IUPAC-Namen und die Konvertierung von maschinenlesbaren Formaten. User können erweiterte Funktionen über Toolkits hinweg in ihren Routinen effektiv erweitern und darauf zugreifen.

Darüber hinaus bietet der Cheminformatik-Mikroservice fortgeschrittene Funktionen wie die Strukturerzeugung (SURGE) und die optische chemische Strukturerkennung (OCSR) unter Verwendung bereits vorhandener Tools;

The Steinbeck Lab has recently released version 2.1.0 of the Cheminformatics Microservice. Diese Version enthält neue Filter, die arzneimittelähnliche Moleküle auf der Grundlage verschiedener Kriterien wie PAINS, QED (Drug Likeness), Lipinski, Ghose, Veber, RHEOS und anderer Filter durchsuchen können. Darüber hinaus sind in dieser Version Aktualisierungen der Pakete CDK, RDKit und OpenBabel sowie weitere kleinere Korrekturen enthalten. Eine vollständige Liste der Änderungen finden Sie im offiziellen GitHub-Repository.

Eine öffentliche Instanz des Mikrodienstes „Cheminformatik“ bietet die Friedrich-Schiller-Universität Jena in Deutschland, zugänglich unter https://api.naturalproducts.net/latest/docs. Der Code für diese Webanwendung befindet sich in GitHub und ist veröffentlicht unter der MIT-Lizenz. Copyright © CC-BY-SA 2024.

Lesen Sie die Swagger-Dokumentation, um einen Einblick in die APIs zu erhalten und deren Angebote zu erkunden. Ausführlichere Informationen über Architektur und Module finden Sie auf der Website Dokumentationsseite.

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