NFDI4Chem kündigt mit Stolz den Start seines Terminologiedienstes für die Chemie-Community an.
Sie fragen sich, wozu das gut ist?
Wie Sie wahrscheinlich wissen, spielen die FAIR-Datengrundsätze eine Schlüsselrolle bei der Entwicklung der NFDI. Einer der Grundsätze fordert insbesondere umfangreiche Metadaten zur Beschreibung von Daten unter Verwendung einer formalen, zugänglichen, gemeinsamen und allgemein anwendbaren Sprache für die Wissensdarstellung. Die Mehrdeutigkeit von Wörtern und Phrasen in natürlicher Sprache, die verwendet werden, um Daten mit ihrer Bedeutung zu annotieren, war bisher ein großes Hindernis. Hier können wir durch die Anwendung domänenspezifischer Terminologien eine deutliche Verbesserung erreichen, die es uns ermöglicht, Daten eindeutig semantisch zu annotieren. Standardisierte Vokabulare, die über die verschiedenen Disziplinen hinweg abgebildet werden, ermöglichen eine echte Interoperabilität der Daten sowie deren Auffindung und Nutzung über unseren eigenen Bereich hinaus.
Unser Terminologiedienst bietet solche chemiespezifischen Terminologien oder Ontologien. Dies ermöglicht es Forscher*innen, Softwaretools und Diensten von NFDI4Chem, maschinen- und menschenlesbare Beschreibungen von Forschungsdaten zu erstellen.
Schritt eins
Die erste Version des Terminologiedienstes erleichtert das Erforschen und Durchsuchen bestehender Ontologien in der Chemie. Sie können nach Begriffen und deren Verwendung in den verschiedenen Ontologien suchen. Außerdem können Sie Ontologiestatistiken und zugehörige beschreibende Metadaten einsehen oder Ontologiedateien herunterladen. Es stehen verschiedene Visualisierungsoptionen zur Verfügung, um eine Ontologie und die Beziehungen zwischen Begriffen zu erkunden. Die Kuratierungsfunktion unterstützt das Vorschlagen neuer Ontologien oder die Empfehlung fehlender Begriffe an den Kurator.
Die Terminologiedienste bieten darüber hinaus eine umfangreiche API, die von anderen Diensten und Softwaretools genutzt werden kann. Ein Beispiel ist die Integration von Terminologien bei der Verwendung des chemotion ELN, um experimentelle Beschreibungen mit Begriffen von Namensreaktionen in der organischen Chemie aus der RXNO-Ontologie zu annotieren. RXNO bietet ein kontrolliertes Vokabular zur eindeutigen Beschreibung angewandter Reaktionen. Die kodierte Semantik, Logik und Taxonomie der Reaktionsklassen ermöglichen in Zukunft semantische Abfragen auf annotierten Daten. Auf die gleiche Weise können Datenrepositorien den Terminologiedienst nutzen, um die semantische Annotation von Forschungsdaten während des Hochladevorgangs zu unterstützen.
Ausblick
In Zukunft wird dieser Ansatz die Interoperabilität heterogener Datenbanken und die datenbankübergreifende semantische Suche ermöglichen. Dies wird es ermöglichen, die Beschränkung der stichwortbasierten Suche zu überwinden und stattdessen eine Suche nach der Bedeutung eines Stichworts durchzuführen.
Die erste Version des Terminologiedienstes enthält 18 Ontologien, die sich als nützlich für NFDI4Chem erwiesen haben. Er wird in Zukunft weiterentwickelt werden, um mehr Ontologien, erweiterte Funktionen und Verknüpfungswerkzeuge für die Ontologiekuratierung und -gestaltung einzubeziehen.
Weitere Informationen finden Sie unter https://terminology.nfdi4chem.de
Wenn Sie Vorschläge für hinzuzufügende Terminologien/Ontologien haben oder sich an den Ontologie-Aktivitäten von NFDI4Chem beteiligen möchten, wenden Sie sich bitte an helpdesk@nfdi4chem.de
Der Terminologiedienst wird von der TIB – Leibniz-Informationszentrum für Technik und Naturwissenschaften entwickelt und gepflegt. Als einer der Infrastrukturpartner innerhalb von NFID4Chem leitet die TIB die Aktivitäten des Aufgabenbereichs 6 – Synergien.
