Die erste euroSAMPL-Challenge <https://gitlab.tu-dortmund.de/kast_ccb/eurosampl/challenge>, organisiert von Stefan Kast, Ricardo Mata, and Paul Czodrowski, wurde ins Leben gerufen, um die SAMPL-Wettbewerbsreihe (Statistical Assessment of Modeling of Proteins and Ligands) fortzusetzen, wobei der Schwerpunkt auf der Vorhersage von pKa-Werten in wässriger Lösung in Kombination mit einer Evaluierung der eingereichten Beiträge hinsichtlich der FAIR-Kriterien sowie der Reproduzierbarkeit lag.
Eine detaillierte Übersicht und Analyse der Ergebnisse wurde kürzlich als „Hot Paper“ in der Fachzeitschrift Phys. Chem. Chem. Phys. als Teil der Themed Collection “The SAMPL Challenges” veröffentlicht, einschließlich Titelbild.
Vollständiges Zitat:
N. Tielker, M. Lim, P. Kibies, J. Gretz, B. Hein-Janke, C. Chodun, R. A. Mata, P. Czodrowski, S. M. Kast, The euroSAMPL1 pKa blind prediction and reproducible research data management challenge, Phys. Chem. Chem. Phys., 2025, 27, 18855-18869.
https://doi.org/10.1039/D5CP01448D
https://doi.org/10.22000/dfqzn3tat216pyzy (RADAR4Chem)
Die nächste euroSAMPL-Wettbewerbsrunde beginnt in Kürze. Dieses Mal geht es um die komplexere Aufgabe, den vollständigen Satz von „Mikro“-pKa-Werten vorherzusagen, die alle 2n Mikrozustände komplexer Moleküle mit n protonierbaren Gruppen verbinden. Neben der Möglichkeit, Berechnungen mit einer Vielzahl von Rechenmethoden durchzuführen, umfasst das Problem auch die FAIRe Dokumentation von Workflows, die zu Vorhersagen verschiedener experimenteller Größen führen, die aus Mikro-pKa-Daten abgeleitet werden, wie z. B. gruppenspezifische pKa-Werte und Titrationskurven.
