Die erste euroSAMPL <https://gitlab.tu-dortmund.de/kast_ccb/eurosampl/challenge>-Challenge, organisiert von Stefan Kast, Ricardo Mata und Paul Czodrowski, wurde ins Leben gerufen, um die SAMPL-Wettbewerbs-Reihe (Statistical Assessment of Modeling of Proteins and Ligands) fortzusetzen, wobei der Schwerpunkt auf der Vorhersage des pKa-Werts in wässrigen Lösungen in Kombination mit einer Evaluierung der eingereichten Beiträge hinsichtlich der FAIR-Kriterien sowie der Reproduzierbarkeit lag.
Eine detaillierte Übersicht und Analyse der Ergebnisse wurde kürzlich als „Hot Paper“ veröffentlicht. <https://pubs.rsc.org/en/journals/articlecollectionlanding?sercode=cp&themeid=61a8f5f8-0d80-42d3-b774-04855f6a9ec3> in the journal Phys. Chem. Chem. Phys. als Teil der Themensammlung „Die SAMPL-Herausforderungen“ <https://pubs.rsc.org/en/journals/articlecollectionlanding?sercode=cp&themeid=d08cdf4d -b703-4536-9d66-5cb40078cac4>, einschließlich Titelbild <https://pubs.rsc.org/en/journals/journalissues/cp#!issueid=cp027036&type=current&issnprint=1463-9076>.
Vollständige Referenz:
N. Tielker, M. Lim, P. Kibies, J. Gretz, B. Hein-Janke, C. Chodun, R. A. Mata, P. Czodrowski, S. M. Kast, The euroSAMPL1 pKa blind prediction and reproducible research data management challenge, Phys. Chem. Chem. Phys., 2025, 27, 18855-18869.
https://doi.org/10.1039/D5CP01448D
https://doi.org/10.22000/dfqzn3tat216pyzy (RADAR4Chem)
Die nächste Runde der euroSAMPL Challenge beginnt in Kürze. Dieses Mal geht es um die komplexere Aufgabe, den vollständigen Satz von „Mikro“-pKa-Werten vorherzusagen, die alle 2n Mikrozustände komplexer Moleküle mit n protonierbaren Gruppen verbinden. Neben der Möglichkeit, Berechnungen mit einer Vielzahl von Berechnungsmethoden durchzuführen, umfasst das Problem auch die FAIR-Dokumentation von Arbeitsabläufen, die zu Vorhersagen verschiedener experimenteller Beobachtungsgrößen führen, die aus Mikro-pKa-Daten abgeleitet werden, wie z. B. gruppenspezifische pKa-Werte und Titrationskurven.
